Pertama berdirinya AKPERPAN (Akademi Pertanian Pandanaran) tahun 1986. Dengan berkembangnya waktu mahasiswa mengalami penurunan drastis khususnnya Pertanian, tidak hanya di Boyolali melainkan se-Solo Raya. Yang disebabkan ketidaktertarikan bidang pertanian. Kemudian Yayasan Bhinneka Karya Boyolali bermerger dengan Yayasan Tunas Bangsa Adi Buana Surakarta. Untuk mendirikan Universitas Boyolali pada tahun 2007 dengan membuka berbagai Fakultas yang salah satunya adalah Fakultas Ekonomi dengan 2 Program Studi (Manajemen dan Akuntansi). Fakultas Ekonomi Universitas Boyolali didirikan pada tahun 2007 berdasarkan Keputusan Mendiknas No. 21/D/O/2008. Pengelolaan Fakultas Ekonomi Universitas Boyolali selanjutnya didasarkan pada UU RI No. 2 Tahun 2003 tentang Sistem Pendidikan Tinggi Nasional. Fakultas Ekonomi telah terakreditasi pertama kalinya tahun 2013 BAN-PT. Disusul akreditasi yang kedua tahun 2017 oleh BAN-PT. Di tahun 2022 ini Fakultas Ekonomi mengajukan reakreditasi ke LAMEMBA dengan 9 kriteria. Fakultas Ekonomi ini memiliki dua Program Studi yaitu Pogram Manajemen dan Program Studi Akuntansi. Pada perkembangannya, UPPS merekrut dosen dengan kualifikasi Pendidikan S2. Hingga saat ini, UPPS telah memiliki 6 Dosen Tetap Program Studi dengan kualifikasi Pendidikan S2, dimana 1 Dosen telah lulus S3 dan dosen sudah mempunyai jabatan Fungsional Asisten Ahli sebanyak 3 dosen, Lektor 2 dosen dan Lektor Kepala 1 dosen.